Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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