Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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PRDM2Q13029 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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