Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms