Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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