Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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