Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC15Q0P6D6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms