Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms