Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL16A1Q07092 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms