Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms