Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms