Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALD1Q05682 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms