Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms