Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms