Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK3Q00526 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms