Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms