Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FAM3AP98173 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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