Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM193AP78312 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM193AP78312 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms