Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTBP60709 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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