Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP6P59044 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms