Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB38P57729 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms