Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms