Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms