Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNPDA1P46926 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms