Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms