Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC19A1P41440 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms