Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms