Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP6P35125 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP6P35125 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP6P35125 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP6P35125 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms