Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms