Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms