Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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HOXD10P28358 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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HOXD10P28358 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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