Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms