Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms