Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms