Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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