Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms