Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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