Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME1P15531 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME1P15531 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME1P15531 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME1P15531 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms