Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms