Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBSLP0DN79 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms