Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM13P0DJ93 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms