Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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