Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA5P08648 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms