Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSP90AB1P08238 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms