Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFLP07196 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms