Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC2O95409 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms