Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRMUO75648 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms