Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL41O60662 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms