Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DENRO43583 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DENRO43583 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms