Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms