Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPA3F8WFD2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms